Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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