Protein–RNA interactions for Protein: O89010

Magea6, MCG114343, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea6O89010 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Magea6O89010 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Magea6O89010 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Magea6O89010 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms