Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1bO70237 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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