Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms