Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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