Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nek2O35942 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nek2O35942 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nek2O35942 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek2O35942 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nek2O35942 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nek2O35942 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nek2O35942 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nek2O35942 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms