Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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