Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NmiO35309 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NmiO35309 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NmiO35309 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NmiO35309 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms