Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Hps1O08983 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hps1O08983 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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