Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms