Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms