Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3278L7N2D2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3278L7N2D2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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