Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2888K7N746 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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