Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms