Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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