Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8356J3QPD3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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