Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm933J3QPC1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm933J3QPC1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms