Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20834J3QM72 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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