Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm17535J3KMR8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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