Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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