Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms