Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3371F7CQW8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3371F7CQW8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms