Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms