Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms