Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Brpf3B2KF05 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms