Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scn7aB1AYL1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scn7aB1AYL1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scn7aB1AYL1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn7aB1AYL1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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