Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde4bB1AWC9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms