Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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