Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms