Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3238W4VSP7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3238W4VSP7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3238W4VSP7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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