Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Speer3W4VSP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer3W4VSP1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer3W4VSP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms