Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms