Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer1Q9Z2Y3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Homer1Q9Z2Y3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer1Q9Z2Y3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms