Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hdac6Q9Z2V5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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