Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms