Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mbd3Q9Z2D8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms