Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne2Q9Z238 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms