Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gdf11Q9Z1W4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf11Q9Z1W4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf11Q9Z1W4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms