Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp2Q9Z0E6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp2Q9Z0E6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms