Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn5Q9WVD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clcn5Q9WVD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms