Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx1Q9WV80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx1Q9WV80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx1Q9WV80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.6 ms