Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul1Q9WTX6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul1Q9WTX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms