Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfe2l3Q9WTM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms