Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubd1Q9R1K7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubd1Q9R1K7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms