Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Slit2Q9R1B9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Slit2Q9R1B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slit2Q9R1B9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slit2Q9R1B9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms