Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek3Q9R0A5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek3Q9R0A5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms