Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsfQ9R013 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsfQ9R013 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsfQ9R013 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms