Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms