Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc1Q9QZF2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gpc1Q9QZF2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpc1Q9QZF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms