Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ChmlQ9QZD5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChmlQ9QZD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmlQ9QZD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms